Tilførslen af energi fra solvinden til magnetosfæren varierer med tiden, fordi solvindens hastighed og tæthed varierer. I forbindelse med bl.a. solpletudbrud øges energitilførslen, og det giver forstyrrelser i magnetfeltet - såkaldte magnetiske storme. I forbindelse med disse storme kan energirige elektroner trænge ned i den øverste atmosfære, hvor de rammer luftmolekyler og atomer og får dem til at lyse. Resultatet er polarlys (nordlys og sydlys). De fleste polarlys forekommer i to ringformede områder centreret omkring de magnetiske poler, de såkaldte polarlysovaler.
Ved DMI forskes i samspillet mellem Solen, magnetosfæren, ionosfæren og atmosfæren.
Fra målestationer i Danmark (tidligere Rude Skov, nu Brorfelde på Midtsjælland) og i Grønland måles bl.a. magnetfeltet og elektriske strømme i ionosfæren.
Rude Skov magnetisk Observatorium
Registreringer af ændringer i jordens magnetfelt forudsætter, at observationen foregår uden uvedkommende magnetisk støj. I slutningen af 1800-tallet lå det magnetiske observatorium i Botanisk Have i København, men på grund af forstyrrelser fra de elektrificerede sporvogne, blev observatoriet flyttet til Rude Skov. Senere blev observatoriet flyttet til Brorfelde, men de gamle observationshytter står stadig i Rude Skov, hvor plakater fortæller om observationerne.

I Rundetaarn gav instrumenter og store fotostater gæsterne indtryk af forholdene på det magnetiske observatorium.
Observatoriets hjerte var en underjordisk hvælving, hvor såkaldte variometre og recordere var anbragt på solide piller med meget stabile temperaturforhold.
|